南海トラフ巨大地震に伴う被害想定のうち、今回は津波の問題に焦点を合わせる。都区部に関しては、水門が閉鎖されている場合と、水門が開放されている場合の2ケースについて、最大津波高と最大浸水分付図が示された（図は、東京都防災ホームページ「南海トラフ巨大地震等による東京の被害想定」から抽出）。

　【水門が閉鎖されている場合】

　東京湾の最大津波高は江東区で2.48mに達する。次いで中央区2.46m、品川区2.44m、港区2.40m、大田区2.37mと続く。ただし、堤防内への浸水は見られず、堤防外にある河川敷の一部に浸水する程度に留まる。

　【水門が開放されている場合】

　最大津波高は品川区で2.34mに留まるなど、水門が閉鎖されている場合に比べると津波高は低くなる。注意しなければならないのは、堤防や護岸が低い個所から浸水が発生すること。

　浸水が発生するのは、江東区のうち都営新宿線に沿った菊川・猿江・毛利の周辺、中央区の月島・勝どきの周辺、浜離宮公園の一帯、大田区の大森南の周辺など。最大浸水深さは1m未満ではあるが、建物が浸水した場合には、地下階に流れ落ちて、電気設備や地下駐車場の設備がダメージを受ける恐れもある。

　なお、最大浸水深さが1m未満の場合には、自力脱出が可能と見なされて、救助対象にはならない。